Iori Kitahara, üniversitedeki ilk yılı için sahil kasabası Izu'ya taşınır ve amcasının dalış dükkânı Grand Blue'nun üst katına yerleşir. Iori'nin ideal bir üniversite deneyimi yaşamakla ilgili büyük umutları ve hayalleri vardır, ancak dükkana girdiğinde, mekana sık sık gelen Dalış Kulübü'nün kaygısız üyelerinin alkolik faaliyetlerinin içine çekilir. Üst sınıflardan Shinji Tokita ve Ryuujirou Kotobuki tarafından ikna edilen Iori, isteksizce onların tuhaf partilerine katılır. Kuzeni Chisa Kotegawa daha sonra içeri girip onu iş üstünde yakalar ve Iori'nin tamamen küçümsemesine neden olur. Kenji Inoue ve Kimitake Yoshioka'nın popüler komedi mangasından uyarlanan Grand Blue, ideal üniversite hayalini gerçekleştirmek için çabalarken bir yandan da tüplü dalış yapmayı öğrenen Iori'nin eksantrik yeni arkadaşlarıyla yaşadığı talihsizlikleri konu alıyor.